Séquençage du microbiome

Génomique Métagénomique Séquençage du microbiome

Qu'est-ce que cette prestation ?

La métagénomique est l'étude du materiel génétique, notamment l'ADN ribosomal pour les bactéries, récupéré directement d'un environnement complexe. Les échantillons sont typiquement filtrés, l'ADN est extrait, une banque est créée et les clones sont séquencés par séquençage à haut débit (NGS). L'intégration des données est une étape critique qui requiert des outils bioinformatiques puissants et permet de créer des unités taxonomiques opérationnelles (OTU).

Quel type d'information et de matériel sont à fournir ?

• Échantillons
Des précisions supplémentaires sur le projet seront demandées directement par l'expert. Vous pourrez échanger directement avec les experts après avoir rempli le formulaire ci-dessous.

Quels sont les différents livrables possibles pour cette prestation ?

  • Extractions d'ADN des échantillons
  • Contrôle qualité des échantillons
  • Préparation de la banque
  • Séquençage NGS - 75 000 lectures par échantillon ou selon indication de l'Expert
  • Alignement en Unité Taxonomique opérationnelle (OTU)
  • Analyses bioinformatiques
  • Rapport détaillé et données brutes pour les publications
  • Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert

Quelles sont les caractéristiques de votre projet ?

Veuillez préciser votre besoin afin que Labtoo puisse identifier les meilleurs prestataires pour votre projet.