Génomique Microarray Analyse des polymorphismes par puces
Cette prestation est basée sur le génotypage de SNP. Cette technologie permet le génotypage du génome entier et le profilage des gènes et exons.Un large choix de puces de génotypage est disponible chez l’homme en fonction de la taille, du nombre d’échantillons, de la localisation de la variation génétique et de la fréquence allélique. Les puces Illumina au contenu standard ou personnalisé sont conçues pour interroger de 300 000 à 5 millions de locus (SNPs et indels) simultanément en formats de 4, 8 ou 24 échantillons avec un conditionnement possible de 48, 96 ou 288 échantillons. Ces puces donnent non seulement des informations sur le génotype du SNP, mais aussi sur le nombre de copie (CNV) pouvant révéler la présence d’anomalies chromosomiques. Le taux de succès de détection des génotypes est en moyenne égal ou supérieur à 98%.
500 ng d’ADN génomique ou 1000 ng d’ADN issus de tissus en FFPE La taille des fragments doit être supérieure ou égale à 2 Kb (photo de gel d’agarose ou profil TapeStation) Si possible dans un volume de 20 µL Information sur le tampon d’élution Préparation en plaque de 96 puits avec plan de plaque associé Pas d’échantillons présentant des risques biologiques
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