Spectrométrie de masse quantitative

Protéomique Quantification Spectrométrie de masse quantitative

Qu'est-ce que cette prestation ?

La Spectrométrie de masse est une technique de chimie analytique qui permet la quantification des protéines dans un échantillon. La quantification peut être absolue, avec l'utilisation de standards internes isotopiques, pour des analyses ciblées uniquement, ou relative, avec marquage isotopique tel que le SILAC, le TMT ou l'iTRAQ, ou sans marquage par la technique label-free. Les prestations disponibles actuellement proposent de la quantification relative en label-free ou avec marquage. Les performances de ces deux types de méthodes sont équivalentes. L’approche SILAC est plus robuste car elle permet de limiter la variabilité expérimentale. Il faut noter qu’elle s’applique à des cellules en culture uniquement et nécessite un nombre important de passages pour assurer un taux élevé d’incorporation des isotopes dans les protéines.

Quel type d'information et de matériel sont à fournir ?

• Échantillons à analyser
• Quantité suffisante
• Marqués avec des isotopes lourds/légers si nécessaire
• Description des échantillons
• Description des requis spécifique (si enrichissement par IP ou chromatography)
• Tailles des protéines d'intérêt
• Description des solutions tampons
Des précisions supplémentaires sur le projet seront demandées directement par l'expert. Vous pourrez échanger directement avec les experts après avoir rempli le formulaire ci-dessous.

Quels sont les différents livrables possibles pour cette prestation ?

  • Traitement des échantillons
  • Dosage des échantillons
  • Digestion trypsine des échantillons
  • Préparation des peptides et lecture LC MS/MS
  • Analyse qualitative et quantitative des données
  • Analyses des modifications post-traductionnelles
  • Rapport d'étude et analyse avancée
  • Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert

Quelles sont les caractéristiques de votre projet ?

Veuillez préciser votre besoin afin que Labtoo puisse identifier les meilleurs prestataires pour votre projet.