Profilage ribosomique

Génomique Séquençage d'ARN Profilage ribosomique

Qu'est-ce que cette prestation ?

Le profilage ribosomique, ou Ribo-seq est une technique qui permet de déterminer quels ARNm sont activement traduits dans un échantillon. En utilisant un traitement à la ribonucléase puis une protéase, Ribo-seq va fournir la localisation exacte des ribosomes sur les ARNm, ce qui permet l'identification de sites d'initiation de la traduction et des compléments d'ORFs traduits dans les cellules, la distribution des ribosomes sur les ARNm et la caractérisation de la vitesse de traduction.

Quel type d'information et de matériel sont à fournir ?

• Échantillons
• Preuve de la qualité ou de l'intégrité des échantillons (trace de Bioanalyzer ou eq.)
• Informations concernant un traitement Rnase
Des précisions supplémentaires sur le projet seront demandées directement par l'expert. Vous pourrez échanger directement avec les experts après avoir rempli le formulaire ci-dessous.

Quels sont les différents livrables possibles pour cette prestation ?

  • Extraction
  • Préparation de la librairie
  • Déplétion
  • Traitement Rnase
  • Séquençage avec nombre de reads
  • Lecture en paired-end
  • Lien pour télécharger les résultats bruts, l'analyse d'activité et les analyses avancées (ou envoi d'un disque dur externe)
  • Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert

Quelles sont les caractéristiques de votre projet ?

Veuillez préciser votre besoin afin que Labtoo puisse identifier les meilleurs prestataires pour votre projet.