Next-Generation Sequencing (NGS)

le 2 déc 2019, par l'équipe Labtoo

L’avènement des techniques de séquençage à haut débit a révolutionné la génomique fonctionnelle. Ces techniques devenues performantes se démocratisent de plus en plus et permettent une grande avancée en matière de recherche.

NGS la révolution de la genomique

C'est quoi exactement ?

Le terme de NGS, également connu sous le nom de "séquençage à haut débit" désigne les différentes technologies de séquençage parmi lesquelles on peut citer :

  • Illumina sequencing (la plus utilisée actuellement)
  • Roche 454
  • Ion torrent
  • SOLiD
  • Helicos BioSciences

Ces technologies permettent de séquencer l'ADN ou l'ARN beaucoup plus rapidement que la très connue technique de Sanger.

Et comment ça marche ?

Trois étapes sont communes à ces technologies :

La préparation de banques

Les banques sont créées en utilisant une fragmentation aléatoire de l'ADN suivie de la liaison avec des petites séquences spécifiques

L'amplification

La banque est amplifiée grâce à des méthodes d'amplification clonale et de PCR

Le séquençage

L'ADN est séquencé en utilisant différentes approches en fonction de la technologie utilisée

Quelles sont les applications ?

En réalité, elles sont nombreuses, cependant, voici quelques exemple d'applications:

Etant une technologie hautement évolutive, la technologie NGS peut être utilisée pour du séquençage de génomes encore non référencés (Séquençage de novo), du re-séquençage de génomes référencés, afin de trouver de nouveaux variants génétiques, de l'analyse de transcrits (RNA-Seq), de l'identification de mutations ponctuelles (SNPs), d'insertions ou de délétions de fragments d'ADN, etc

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