La métagénomique est l'étude du materiel génétique, notamment l'ADN ribosomal pour les bactéries, récupéré directement d'un environnement complexe.
Les échantillons sont typiquement filtrés, l'ADN est extrait, une banque est créée et les clones sont séquencés par séquençage à haut débit (NGS).
L'intégration des données est une étape critique qui requiert des outils bioinformatiques puissants et permet de créer des unités taxonomiques opérationnelles (OTU).
Matériel et information requis
Echantillons
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Livrables possibles pour cette prestation
Extractions d'ADN des échantillons
Contrôle qualité des échantillons
Préparation de la banque
Séquençage NGS
Alignement en Unité Taxonomique opérationnelle (OTU)
Analyses bioinformatiques
Rapport détaillé et données brutes pour les publications
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