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Echantillons biologiques d'infection bactériennes :
Utilisation en R&D et Approvisionnement
Le développement de médicaments et de tests diagnostiques pour le traitement et la détection des infections d'origines bactériennes nécessite de réaliser des études sur des échantillons biologiques provenant de patients atteints d'infections bactériennes.
Petit tour d'horizon des différentes maladies infectieuses causées par une infection bactérienne et de la manière dont le service proposé par Labtoo contribue à accélérer les projets de R&D de l'industrie pharmaceutique.
Vous recherchez des échantillons biologiques de patients atteints d'une infection bactérienne ?
Que sont les bactéries pathogènes ?
Les bactéries pathogènes, bien au-delà des Escherichia coli et Streptococcus bien connus, représentent une vaste catégorie d'agents infectieux. Leur toxicité et leurs modes de transmission sont variés, dépendant de multiples facteurs. Les zones les plus fréquemment touchées par les infections bactériennes incluent les voies respiratoires (ORL, bronches et poumons), le tractus gastro-intestinal (de l'estomac au colon) et le système urogénital. Les voies de contamination peuvent être aériennes, par contact indirect avec de l'eau ou des aliments contaminés, ou encore par contact direct avec des personnes infectées. De plus, certaines bactéries pathogènes peuvent être transmises par des vecteurs biologiques tels que les moustiques, les tiques, les mouches ou les puces. Une compréhension approfondie de ces différents modes de transmission et des bactéries impliquées est essentielle pour la prévention, le diagnostic et le traitement efficace des infections bactériennes.
Cette page sera dédié a énuméré certaines des bactéries les plus fréquente en fonction de leur mode de transmission.
| Exemple de Bactérie | Domaine d'infection | Symptômes couramment associés |
|---|---|---|
| Mycobacterium tuberculosis | Pulmonaire | Toux persistante, fièvre, perte de poids, fatigue |
| Neisseria gonorrhoeae | Urogénital | Écoulement purulent, douleurs ou brûlures à la miction (hommes), pertes vaginales anormales, douleurs abdominales basses (femmes) |
| Borrelia burgdorferi | Vectorielle (transmise par les tiques) | Érythème migrant (tache rouge qui s'agrandit), fatigue, fièvre, douleurs articulaires (symptômes de la maladie de Lyme) |
| Escherichia coli | Gastro-intestinal | Diarrhée, crampes abdominales, nausées, vomissements |
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Labtoo vous assiste dans vos recherches d'échantillons biologiques de patients atteints d'une infection bactérienne. Notre équipe se charge du projet de transfert de matériel biologique du début à la livraison des échantillons.
- Réalisation d'une faisabilité de la disponibilité des échantillons ou de la collecte clinique auprès de centres cliniques référencés
- Validation des aspects réglementaires
- Mise en place d'une structure contractuelle
- Envoi des échantillons souhaités dans les conditions appropriées
- Transfert des données cliniques associées
- Autres services analytiques et expérimentaux
Types d'échantillons disponibles
Urines
Dans le contexte d'une infection urinaire, un échantillon d'urine est recueilli pour réaliser un examen cytobactériologique des urines (ECBU) en vue de confirmer la présence de l'agent pathogène. Ces échantillons peuvent être ultérieurement conservés dans des conditions appropriées en vue de projets de recherche futurs.
Feces
Dans les cas d'infection gastro-intestinal, la collecte d'échantillons fécaux est cruciale pour identifier l'agent pathogène. Ces échantillons peuvent également être conservés pour des recherches ultérieures.
Liquide céphalorachidien
Dans le cas d'une infection du système nerveux, la collecte d'échantillons de liquide céphalorachidien (LCR) est nécessaire pour identifier l'agent pathogène ainsi que son stade d'avancement. Ces échantillons peuvent également être conservés pour des recherches ultérieures.
Autres
D'autres types de prélèvements tels que des écouvillons nasopharyngés, respiratoires ou vaginaux sont aussi fréquemment utilisés dans la recherche sur les maladies d'origine infectieuse.
- Tissus frais : Des prélèvements dermiques, tels que les échantillons de plaies ou d'abcès cutanés, sont souvent réalisés pour identifier et étudier la présence de cette bactérie pathogène dans les infections cutanées.
- Tissus congelés (OCT et FF)
- Tissus FFPE
- Sang totale de patients atteints d'une infection bactérienne.
- PBMC
- Plasma
- Sérum
- Leucaphérèse
Données cliniques associées typiques
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- Age
- Sexe
- Méthode de détection
- Résultat sérologique
- Charge bactérienne
- Traitement suivi
- Symptomatologie
- Imagerie médicale
- Positivité/négativité à certaines infections
- Autres
Notre service identifie les sites cliniques capables de préparer et de transférer une collection d'échantillons pour un projet donné.
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Les bactéries respiratoires
Diverses bactéries sont capables d'infecter les voies respiratoires supérieures (sinus, pharynx et larynx) et inférieures (trachée, bronches et parenchyme pulmonaire), entraînant diverses conditions cliniques telles que la bronchite, la pneumonie, la rhinopharyngite, l'otite moyenne, la sinusite ou une angine. Elles peuvent également aggraver les difficultés respiratoires chez les personnes souffrant de problèmes respiratoires tels que la bronchopneumopathie ou l'asthme.
Ces bactéries sont généralement transmises par contact direct avec des gouttelettes en suspension dans l'air provenant d'éternuements de personnes infectées. Une transmission indirecte peut également se produire par l'inhalation de gouttelettes provenant d'eau contaminée, par exemple à partir de tours de refroidissement ou de climatiseurs mal entretenus.
Le traitement varie en fonction de la zone d'infection. Par exemple, les infections bronchiques étant souvent d'origine virale, l'utilisation d'antibiotiques est déconseillée si le diagnostic de l'origine infectieuse n'est pas totalement certain.
Parmi ces bactéries, on trouve notamment :
Mycoplasma pneumoniae
Responsable de la pneumonie atypique, une maladie généralement bénigne mais pouvant être grave chez les nourrissons ou les personnes avec des problèmes de santé sous-jacents.
Les symptômes dcomprennent une toux sèche, persistante et non productive, des maux de gorge, une fièvre légère à modérée, des maux de tête, une fatigue et parfois des douleurs musculaires.
Mycoplasma pneumoniae est une bactérie atypique en raison de son manque de paroi cellulaire, ce qui la rend résistante à de nombreux antibiotiques courants.
Legionella pneumophila
Bactérie responsable de la légionellose, une infection pulmonaire potentiellement grave chez l'homme.
Elle se développe dans des environnements aquatiques (climatiseur, tours de refroidissements...)et peut être inhalée sous forme d'aérosols.
Les symptômes comprennent une forte fièvre, des frissons, des maux de tête, des douleurs musculaires, une toux sèche et des difficultés respiratoires, avec des complications possibles chez les personnes vulnérables.
Moraxella catarrhalis
Bactérie courante chez l'Homme, souvent associée à des pathologies respiratoires telles que la sinusite, la bronchite et la pneumonie.
Elle est pathogène, notamment chez les personnes âgées, les enfants et les personnes souffrant de maladies pulmonaires chroniques.
Les symptômes incluent une toux persistante, souvent accompagnée de crachats purulents, des douleurs thoraciques, de la fièvre, une congestion nasale et des maux de gorge.
Les bactéries du tractus intestinale
Parmi les infections intestinales, en plus des infections à Escherichia coli pathogènes, diverses bactéries peuvent causer des diarrhées plus ou moins sévères accompagnées de douleurs abdominales. Certaines d'entre elles ont la capacité de produire des toxines qui peuvent affecter divers organes de l'organisme.
La transmission de ces bactéries se fait principalement par l'ingestion d'eau ou d'aliments contaminés. La pathogénicité peut résulter de la bactérie elle-même ou de la toxine qu'elle produit. De plus, la transmission peut également se produire par contact direct avec des individus contaminés.
Les traitements varient en fonction de l'espèce bactérienne, de la localisation de l'infection et de sa gravité. Cependant, les antibiotiques associés à des antidiarrhéiques sont souvent prescrits. Il est également recommandé de maintenir une bonne hydratation et de reposer l'intestin en évitant les aliments lourds.
Parmi les espèces bactériennes pathogènes du tractus intestinal, on trouve notamment :
Salmonella spp
Elle est responsable de la salmonellose, cette bactérie adhère aux cellules de la muqueuse intestinale, entraînant des dommages et des perturbations de la fonction intestinale. Elle est couramment associée à une ingestion d'aliments contaminés tels que la viande, les œufs, les produits laitiers ou les produits à base de légumes.
Campylobacter jejuni
Souvent associée à la consommation de viande de volaille contaminée ou d'eau non traitée, cette bactérie peut provoquer des infections gastro-intestinales, parfois sévères chez les jeunes enfants ou les personnes immunodéprimées.
Clostridium
Ce genre comprend plusieurs espèces pathogènes produisant des toxines potentiellement mortelles.
Clostridium difficile, par exemple, peut entraîner des troubles intestinaux graves chez les personnes sous antibiotiques.
Clostridium botulinum, quant à lui, produit une neurotoxine responsable du botulisme, une maladie paralytique potentiellement mortelle.
Vibrio cholerae
Responsable du choléra, cette bactérie provoque une diarrhée aqueuse sévère due à une sur-sécrétion de liquide intestinal induite par une toxine spécifique, la toxine cholérique. Elle est principalement transmise par l'ingestion d'eau ou d'aliments contaminés par des matières fécales.
Listeria monocytogenes
Cette bactérie peut causer la listériose en traversant la barrière intestinale et en envahissant les tissus de l'organisme, entraînant des infections graves telles que des méningites ou des septicémies.
Elle est souvent retrouvée dans des produits laitiers non pasteurisés.
Les bactéries urogénital
Les infections urogénitales résultent de l'activité pathogène de diverses bactéries, pouvant affecter les organes génitaux, le système urinaire ou d'autres parties du système urogénital.
Les symptômes les plus fréquents incluent des écoulements anormaux des organes génitaux, des douleurs lors de la miction, des démangeaisons, des douleurs pendant les rapports sexuels ou des éruptions cutanées localisées dans la zone génitale. La transmission de ces infections peut se faire par plusieurs vecteurs, mais le plus commun est la transmission par rapport sexuel non protégé, ce qui en fait souvent des infections sexuellement transmissibles (IST).
Parmi les espèces bactériennes pathogènes urogénitales les plus courantes, on retrouve :
Neisseria gonorrhoeae
Causant la gonorrhée, cette bactérie infecte la muqueuse des organes génitaux, de l'anus et parfois la gorge. Chez les hommes, les symptômes typiques incluent un écoulement purulent du pénis, des douleurs ou des brûlures lors de la miction et des douleurs testiculaires.
Chez les femmes, ils peuvent inclure des pertes vaginales anormales, des douleurs abdominales basses et des saignements entre les règles.
La gonorrhée non traitée peut entraîner des complications graves en se propageant à d'autres parties du corps telles que les articulations, la peau, le cœur et le système nerveux.
Chlamydia trachomatis
Responsable de la chlamydiose, cette bactérie infecte les cellules de la muqueuse génitale, provoquant une inflammation locale.
Les zones les plus souvent touchées sont le col de l'utérus chez les femmes et l'urètre chez les hommes. Elle peut être asymptomatique, mais les symptômes courants comprennent des douleurs lors de la miction, des douleurs abdominales basses et des saignements entre les règles chez les femmes, ainsi que des gonflements testiculaires chez les hommes.
Sans traitement, la chlamydiose peut entraîner des complications telles que l'inflammation pelvienne chez les femmes ou des urétrites chez les hommes, et potentiellement l'infertilité.
Treponema pallidum
Agent responsable de la syphilis, cette bactérie infecte principalement les organes génitaux mais peut également affecter d'autres parties du corps.
L'infection passe par plusieurs stades : Le premier se caractérise par l'apparition d'un chancre indolore au site d'infection, souvent sur les organes génitaux, l'anus ou la bouche.
Le second par une éruption cutanée, des lésions aux muqueuses et des ganglions lymphatiques enflés.
Sans traitement, l'infection peut progresser vers le stade tertiaire, causant des dommages graves aux organes internes, au système nerveux et au cerveau.
Les bactéries vectorielles
Les bactéries vectorielles représentent des agents pathogènes qui sont transmis à l'homme par des vecteurs biologiques tels que les tiques, les puces ou les moustiques. La gravité des infections varie en fonction du pathogène en question ainsi que de la réponse immunitaire de l'hôte.
Bien que les maladies qu'elles engendrent présentent des spécificités propres à chaque espèce, certains symptômes sont courants, tels qu'une élévation de la température corporelle, des céphalées, de la fatigue, ainsi que des douleurs musculaires et articulaires.
Parmi les bactéries pathogènes transmises par des vecteurs, on peut citer :
Borrelia burgdorferi
Cette bactérie est communément transmise par la morsure de tiques et est responsable de la maladie de Lyme.
Les symptômes de cette maladie peuvent varier selon les individus et les stades de l'infection. Dans sa phase initiale, elle se caractérise souvent par une éruption cutanée appelée érythème migrant, accompagnée de fièvre, de fatigue, de céphalées et de douleurs musculaires et articulaires.
En l'absence de traitement, elle peut évoluer vers des formes plus avancées, entraînant des complications neurologiques, cardiaques, articulaires et cutanées. Un traitement précoce permet généralement de guérir la maladie, tandis que des complications surviennent en l'absence de traitement initial.
Rickettsia rickettsii
Transmise par les tiques, cette bactérie est responsable de la fièvre pourprée des montagnes Rocheuses, une maladie caractérisée par de la fièvre, des éruptions cutanées et des douleurs articulaires.
Rickettsia typhi
Transmise par les puces, cette bactérie est à l'origine du typhus murin.
Cette maladie se manifeste par de la fièvre, des éruptions cutanées et des douleurs articulaires, pouvant entraîner des complications graves telles que des atteintes pulmonaires et cardiaques.
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Streptococcus