Echantillons biologiques d'infections fongiques :
Utilisation en R&D et Approvisionnement

Le développement de médicaments et de tests diagnostiques pour le traitement et la détection d'une infection fongique nécessite de réaliser des études sur des échantillons biologiques provenant de patients atteints d'une infection fongique.

Petit tour d'horizon des différentes maladies infectieuses causées par une infection fongique et de la manière dont le service proposé par Labtoo contribue à accélérer les projets de R&D de l'industrie pharmaceutique.

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Vous recherchez des échantillons biologiques de patients atteints d'une infection d'origine fongique ?

Quelles sont les infections fongiques ?

Les champignons, également appelés mycètes, constituent un groupe d'organismes distincts, n'appartenant ni au règne animal ni au règne végétal. Ils sont ubiquitaires dans l'environnement humain, présents dans l'air ambiant, sur la peau et dans la flore intestinale. De manière générale, on distingue deux principales formes de champignons : les levures et les moisissures. Bien que la plupart des champignons soient innocents, certains peuvent être pathogènes pour l'Homme.

Les infections fongiques sont classées en deux catégories principales : les infections primaires et les infections opportunistes. Ces infections peuvent ensuite être qualifiées de localisées ou systémiques en fonction de leur gravité.

Les infections primitives

Ces infections fongiques peuvent toucher toute personne. Parmi les plus courantes figurent la coccidioïdomycose, l'histoplasmose, la blastomycose et la paracoccidioïdomycos.

Ces espèces ne sont pas présentes en Europe et sont endémiques dans différentes régions d'Amérique, d'Asie, d'Afrique ou d'Australie. Cependant, en raison de la lenteur de la multiplication de ces espèces, les personnes voyageant dans un pays étranger peuvent être exposées à la contamination et ne développer des symptômes que plusieurs années plus tard 

Les infections opportunistes

Ces infections affectent exclusivement les personnes ayant un système immunitaire affaibli. Parmi les infections fongiques opportunistes les plus courantes, on retrouve la candidose et l'aspergillose.

Les infections localisées

Elles affectent généralement une seule région du corps, telles que les ongles, la peau, la bouche, le nez ou le vagin. Elles sont souvent bénignes et se traitent généralement rapidement. N'importe quel individu peut être atteint par ce type d'infection.

Les infections systémiques

Elles sont beaucoup plus graves, impliquant une propagation des champignons dans les organes internes. Elles se propagent rapidement, entraînant souvent des septicémies létales.

Ces infections sont principalement opportunistes, ce qui signifie qu'elles sont causées par des champignons présents dans l'environnement, mais normalement contrôlés par le système immunitaire. Elles touchent donc principalement les personnes immunodéprimées.


Néanmoins, une infection systémique peut arriver chez une personne ayant une immunité normale, tout dépend de la durée et de la charge d'éléments infectieux intégrés.

Champignon pathogène Caractéristiques spécifiques Symptômes associés
Candida albicans Levure

- Muguet buccal (candidose buccale)

- Infections génitales (candidose vaginale)

- Infections cutanées ou des ongles

Aspergillus spp.  Moisissure

- Infections respiratoires (aspergillose pulmonaire)

- Infections cutanées

- Sinusite fongique

Cryptococcus spp.  Levure

Méningite cryptococcique

- Infections pulmonaires 

- Symptômes neurologiques en cas de dissémination dans le système nerveux central

Histoplasma capsulatum  Levure

- Fièvre/toux/fatigue

- Perte de poids 

- Symptômes respiratoires (dyspnée, douleur thoracique)

Coccidioides spp.  Moisissure

- Fièvre/toux/fatigue

- Douleurs thoraciques 

- Myalgies

- Éruption cutanée 

Blastomyces dermatitidis  Levure

- Fièvre/toux

- Frissons

- Sudation nocturne 

- Douleur thoracique

 

Illustration d'une infection fongique
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Découvrez le service Labtoo pour vos recherche d'échantillons biologiques

Labtoo vous assiste dans vos recherches d'échantillons biologiques de patients atteints d'une infection fongique. Notre équipe se charge du projet de transfert de matériel biologique du début à la livraison des échantillons.

  • Réalisation d'une faisabilité de la disponibilité des échantillons ou de la collecte clinique auprès de centres cliniques référencés
  • Validation des aspects réglementaires
  • Mise en place d'une structure contractuelle
  • Envoi des échantillons souhaités dans les conditions appropriées
  • Transfert des données cliniques associées
  • Autres services analytiques et expérimentaux

Types d'échantillons disponibles

Tissus

Tissus frais

Les prélèvements dermiques sont fréquemment réalisés à partir des éruptions cutanées causées par une infection fongique. Les tissus provenant de zones infectées, plus profondes sont également des échantillons privilégiés pour la recherche.

Tissus congelés (OCT et FF)

De manière similaire aux tissus frais, une fois que les tissus sont autorisés pour la recherche, le site clinique peut congeler et conserver les échantillons de tissus congelés à -80°C ou dans de l'azote liquide pour une utilisation ultérieure.

Tissus FFPE

Les pathologistes ont l'habitude d'inclure les biopsies et les résections dans de la paraffine. Les blocs FFPE de tissus infectés peuvent être utilisés ultérieurement à des fins de recherche.

Dérivés du sang
Biofluides
  • Sang total de patients atteints d'une infection fongique
  • PBMC (cellules mononuclées du sang périphérique)
  • Plasma
  • Sérum
  • Leucaphérèse
  • Urine
  • Echantillon respiratoire
  • Feces
  • Autres

Données cliniques associées typiques

    • Age
    • Sexe
    • Méthode de détection
    • Symptomatologie 
    • Résultats PCR
    • Résultat sérologique
    • Traitement suivi
    • Imagerie médicale
    • Positivité/négativité à certaines infections
    • Autres
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Notre service identifie les sites cliniques capables de préparer et de transférer une collection d'échantillons pour un projet donné.

Demandez à notre équipe de discuter de votre projet.

Les symptômes des infections fongiques

Les symptômes d'une infection fongique peuvent varier en fonction de la localisation de l'infection, du type de champignon impliqué et de la gravité de l'affection. Voici quelques symptômes typiques associés aux infections fongiques dans différentes parties du corps :

Infections cutanées

Éruptions cutanées, rougeur et démangeaisons, formation de plaques rouges ou squameuses, présence de cloques ou de pustules, peau qui pèle…

Infections des ongles

Changement de couleur, de texture et d'épaisseur de l'ongle, décollement de l'ongle du lit, fragilisation de l'ongle, douleur autour de l'ongle.

Infections des voies respiratoires

Toux, essoufflement, douleur thoracique, crachats de couleur particulière voire sanglants, fièvre et fatigue.

Infections génitales

Démangeaisons et irritation, écoulement anormal, épais et/ou malodorant, brûlures lors de la miction, douleur lors de rapports sexuels, rougeur et gonflement de l'appareil génital.

Infections systémiques

Fièvre persistante, fatigue, perte d'appétit, douleurs musculaires et symptômes plus spécifiques en fonction des organes touchés.

 

Diagnostique et traitements d'une infection fongique

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Lorsqu'une suspicion d'infection fongique est soulevée, le médecin engage un interrogatoire du patient afin d'explorer son historique de voyages, en particulier dans les régions exposées à un risque d'infection fongique, dans le but d'évaluer la probabilité d'une infection primaire. De plus, le médecin interroge le patient sur d'éventuels problèmes immunitaires ou récents traitements antibiotiques susceptibles de favoriser une infection fongique opportuniste.

Par la suite, le diagnostic est confirmé par le prélèvement d'un échantillon biologique du patient, suivi d'une culture sur un milieu de croissance fongique approprié. Le type d'échantillon prélevé est déterminé en fonction de la localisation présumée de l'infection. Par exemple, un échantillon cutané ou un échantillon d'ongle est prélevé pour les infections cutanées, tandis qu'une expectoration ou une bronchoscopie peut être nécessaire pour les infections pulmonaires. Des analyses sanguines sont également effectuées pour détecter la présence d'anticorps spécifiques aux champignons ou pour identifier des gènes spécifiques à certains types de champignons en utilisant des techniques de biologie moléculaire.

Le choix du traitement dépend de plusieurs facteurs, y compris l'espèce du champignon impliqué, la localisation de l'infection et son stade de progression.

Les traitements des infections fongiques impliquent  l'utilisation de médicaments antifongiques. Ces médicaments peuvent être administrés par voie topique sous forme de pommades, par voie orale sous forme de comprimés, ou par voie intraveineuse.Les antifongiques appartiennent à quelques familles distinctes, notamment les polyènes, qui ciblent la membrane cellulaire fongique, les azolés, qui inhibent la synthèse de l'ergostérol, les échinocandines, qui agissent sur la paroi cellulaire fongique, et les antimétabolites, tels que la flucytosine, qui interfèrent avec la synthèse de l'ADN fongique en inhibant la thymidylate synthase.

Dans les cas plus sévères, tels que les abcès ou les infections tissulaires profondes, une intervention chirurgicale excisionnelle peut être nécessaire pour éliminer les tissus infectés.

Complications lors d'une infection fongique

Les infections fongiques invasives représentent une catégorie clinique à haut risque, caractérisée par l'invasion des tissus de l'organisme par des champignons au-delà de leurs sites de colonisation habituels. Ce phénomène peut conduire à des infections généralisées et accroître le risque de septicémie. Les personnes immunodéprimées sont particulièrement sujettes à ce type d'infections. De plus, de lourde séquelle peuvent survenir lorsque des organes sensibles tels que les yeux, les reins, les poumons ou le foie ont été affectés.

La résistance aux antifongiques constitue également un problème croissant dans le domaine médical. Cette résistance est souvent attribuable au spectre d'action limité de ces agents antifongiques contre une variété d'organismes fongiques. Cette problématique complique la gestion des infections fongiques et nécessite une attention particulière dans la sélection et l'utilisation des antifongiques pour garantir leur efficacité clinique.

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    Sample FR
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