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Service de Profilage ribosomique par NGS
Description du service
Le
profilage ribosomique, ou Ribo-seq
est une technique qui permet de déterminer
quels ARNm sont activement traduits
dans un échantillon.
En utilisant un traitement à la ribonucléase puis une protéase, Ribo-seq va fournir la
localisation exacte des ribosomes sur les ARNm
, ce qui permet
l'identification de
sites d'initiation de la traduction,
des compléments d'ORFs
traduits dans les cellules,
la distribution
des ribosomes sur les ARNm
et
la caractérisation de la
vitesse de traduction
.
Matériel et information requis
Échantillons à analyser
Informations concernant un traitement RNase
Preuve de la qualité ou de l'intégrité des échantillons (trace de Bioanalyzer ou eq.)
Des précisions sur le projet peuvent être demandées.
Vous pourrez échanger directement avec les experts après avoir rempli le formulaire ci-dessous
Livrables possibles pour cette prestation
Extraction
Préparation de la librairie
Déplétion
Traitement Rnase
Séquençage avec nombre de reads
Lecture en paired-end
Lien pour télécharger les résultats bruts, l'analyse d'activité et les analyses avancées (ou envoi d'un disque dur externe)
Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert
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