Séquençage de nouvelle génération : Qu'est-ce que c'est et quand l'utiliser ?  

le 2 déc 2019, par l'équipe Labtoo

L’avènement des techniques de séquençage à haut débit a révolutionné la génomique fonctionnelle. Ces techniques devenues performantes se démocratisent de plus en plus et permettent une grande avancée en matière de recherche.

 

C'est quoi exactement ?

Le terme de NGS (Next Generation Sequencing), également connu sous le nom de "séquençage à haut débit" désigne les différentes technologies de séquençage parmi lesquelles on peut citer :

  • Illumina sequencing (la plus utilisée actuellement)
  • Roche 454
  • Ion torrent
  • SOLiD
  • Helicos BioSciences

Ces technologies permettent de séquencer l'ADN ou l'ARN beaucoup plus rapidement que la très connue technique de Sanger.

 

Et comment ça marche ?

Trois étapes sont communes à ces technologies :

La préparation de banques

Les banques sont créées en utilisant une fragmentation aléatoire de l'ADN suivie de la liaison avec des petites séquences spécifiques

L'amplification

La banque est amplifiée grâce à des méthodes d'amplification clonale et de PCR

Le séquençage

L'ADN est séquencé en utilisant différentes approches en fonction de la technologie utilisée

 

Quelles sont les applications ?

En réalité, elles sont nombreuses, cependant, voici quelques exemple d'applications: Etant une technologie hautement évolutive, la technologie NGS peut être utilisée pour du séquençage de génomes encore non référencés (Séquençage de novo), du re-séquençage de génomes référencés, afin de trouver de nouveaux variants génétiques, de l'analyse de transcrits (RNA-Seq), de l'identification de mutations ponctuelles (SNPs), d'insertions ou de délétions de fragments d'ADN, etc

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