Détermination in silico des épitopes reconnus par un anticorps
Description du service
La structure de l'anticorps peut être modélisée, ainsi seule la séquence est nécessaire.
La structure de la cible doit être résolue pour assurer la meilleure efficacité de prédiction.
Le nombre de fois que chaque acide aminé devrait être dans l'épitope parmi les 30 meilleures solutions est calculé et des peptides sont conçus parmi ces acides aminés.
Pour cette raison, les épitopes linéaires et les épitopes conformationnels peuvent être pris en compte pour des validations.
Les peptides sont ensuite utilisés pour réaliser des techniques de pointe d’interactions protéine-protéine.
Matériel et information requis
Séquence de l'anticorps
Des précisions sur le projet peuvent être demandées.
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Livrables possibles pour cette prestation
Fichiers PDB des 30 structures les mieux classées de complexes anticorps-antigènes
Séquences de peptides
Données expérimentales brutes et analysées
Rapport complet avec méthodes de validation
Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert
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