Service de Profilage ribosomique par NGS

SEQUENCAGE ARNm300X225

Description du service

  • Le profilage ribosomique, ou Ribo-seq est une technique qui permet de déterminer quels ARNm sont activement traduits dans un échantillon.
  • En utilisant un traitement à la ribonucléase puis une protéase, Ribo-seq va fournir la localisation exacte des ribosomes sur les ARNm, ce qui permet
    • l'identification de sites d'initiation de la traduction,
    • des compléments d'ORFs traduits dans les cellules,
    • la distribution des ribosomes sur les ARNm et
    • la caractérisation de la vitesse de traduction.

Matériel et information requis

  • Échantillons à analyser
  • Informations concernant un traitement RNase
  • Preuve de la qualité ou de l'intégrité des échantillons (trace de Bioanalyzer ou eq.)
  • Des précisions sur le projet peuvent être demandées.
  • Vous pourrez échanger directement avec les experts après avoir rempli le formulaire ci-dessous

Livrables possibles pour cette prestation

  • Extraction
  • Préparation de la librairie
  • Déplétion
  • Traitement Rnase
  • Séquençage avec nombre de reads
  • Lecture en paired-end
  • Lien pour télécharger les résultats bruts, l'analyse d'activité et les analyses avancées (ou envoi d'un disque dur externe)
  • Étude correspondant au cahier des charges validé avec l'Expert
Formulaire

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